Неутрализиращо бягство от подварианти на SARS-CoV-2 Omicron BA.2.12.1, BA.4 и BA.5

До редактора:

Подвариантни мутации на Omicron и отговори на неутрализиращите антитела.

Панел А показва линията на мутации, които са били идентифицирани в подвариантите омикрон BA.1, BA.2, BA.2.12.1 и BA.4 или BA.5 на SARS-CoV-2, в сравнение с референтния WA1 / 2020 изолация. BA.4 и BA.5 имат идентични последователности на шиповия протеин и по този начин са групирани заедно. FP означава слят пептид, HR1 хептаден повторение 1, HR2 хептадно повторение 2, NTD N-терминален домен, RBD рецептор-свързващ домен, RBM рецептор-свързващ мотив, SD1 поддомейн 1 и SD2 поддомейн 2. Панел B показва неутрализиращи титри на антитела, както е определено чрез базирани на луцифераза псевдовирусни тестове за неутрализация в проби, получени от 27 участници 6 месеца след получаване на двудозовата серия BNT162b2 месинджър РНК ваксина и 2 седмици след третата (бустерна) доза. Панел C показва титри на неутрализиращи антитела при участници, които са били заразени с подвариант BA.1 или BA.2. Всички заразени участници са били ваксинирани с изключение на 1 участник, който е имал отрицателен титър на неутрализиращи антитела. При 9 участници са показани две или три времеви точки след заразяване. Титрите на неутрализиращи антитела бяха измерени срещу референтния изолат на SARS-CoV-2 WA1 / 2020 и подвариантите омикрон BA.1, BA.2, BA.2.12.1 и BA.4 или BA.5. В панели B и C медианите (черни ленти) са показани цифрово и са посочени факторните разлики от другите подварианти; пунктираната хоризонтална линия показва долната граница на откриване за анализа.

През последните месеци се появиха множество линии на омикрон (B.1.1.529) вариант на тежък остър респираторен синдром коронавирус 2 (SARS-CoV-2),1 с подварианти BA.1 и BA.2, показващи значително освобождаване от неутрализиращи антитела.2-5 Подвариант BA.2.12.1 сега е доминиращият щам в Съединените щати, а BA.4 и BA.5 са доминиращи в Южна Африка (Фигура 1А). Подвариантите BA.4 и BA.5 имат идентични последователности на шиповия протеин.

Ние оценихме неутрализиращите титри на антитела срещу референтния WA1 / 2020 изолат на SARS-CoV-2 заедно с омикронни подварианти BA.1, BA.2, BA.2.12.1 и BA.4 или BA.5 при 27 участници, които са били ваксинирани и подсилени с месинджър РНК ваксина BNT162b2 (Pfizer – BioNTech) и при 27 участници, които са били заразени с подвариант BA.1 или BA.2 средно 29 дни по-рано (диапазон от 2 до 113) (Таблици S1 и S2 в Допълнителното приложение, достъпно с пълния текст на това писмо на NEJM.org). В кохортата на ваксините участниците бяха изключени, ако са имали анамнеза за SARS-CoV-2 инфекция или положителен резултат от нуклеокапсиден серологичен анализ или ако са получили друга ваксина срещу коронавирусна болест 2019 (Covid-19) или имуносупресивно лекарство.

Шест месеца след първоначалните две имунизации с BNT162b2, средният титър на псевдовирусни неутрализиращи антитела беше 124 срещу WA1 / 2020, но по-малко от 20 срещу всички тествани подварианти на омикрон (Фигура 1В). Две седмици след прилагане на бустер дозата, средният титър на неутрализиращото антитяло се е увеличил значително до 5783 срещу WA1 / 2020 изолат, 900 срещу подвариант BA.1, 829 срещу подвариант BA.2, 410 срещу BA.2.12.1 подвариант и 275 срещу подвариант BA.4 или BA.5. Тези данни показват, че в сравнение с отговора срещу WA1 / 2020 изолат, титърът на неутрализиращото антитяло е по-нисък с фактор 6,4 срещу BA.1, с фактор 7,0 срещу BA.2, с фактор 14,1 срещу BA. 2.12.1 и с коефициент 21,0 спрямо BA.4 или BA.5. В допълнение, в сравнение със средния титър на неутрализиращо антитяло срещу подварианта BA.1, средният титър е по-нисък с коефициент 2,2 спрямо подварианта BA.2.12.1 и с фактор 3,3 спрямо подварианта BA.4 или BA. 5 подвариант.

Сред участниците, които са били заразени с подварианта BA.1 или BA.2 на omicron, всички освен един са били ваксинирани срещу Covid-19. Поради вариациите в вземането на проби след началото на инфекцията, някои проби може да не отразяват пикови титри на неутрализиращи антитела (Таблица S2). Сред участниците с анамнеза за Covid-19, средният титър на неутрализиращите антитела е 11 050 срещу изолат WA1 / 2020, 1740 срещу подвариант BA.1, 1910 срещу подвариант BA.2, 1150 срещу подвариант BA.2.12.1. и 590 срещу подварианта BA.4 или BA.5 (Фигура 1C). Тези данни показват, че в сравнение с изолата WA1 / 2020, средният титър на неутрализиращото антитяло е по-нисък с фактор 6,4 спрямо BA.1, с фактор 5,8 срещу BA.2, с фактор 9,6 спрямо BA.2.12. 1 и с коефициент 18,7 спрямо BA.4 или BA.5. Освен това, в сравнение със средните титри спрямо подварианта BA.1, средният титър е по-нисък с коефициент 1,5 спрямо подварианта BA.2.12.1 и с фактор 2,9 спрямо подварианта BA.4 или BA.5 .

Тези данни показват, че подвариантите BA.2.12.1, BA.4 и BA.5 по същество избягват неутрализиращите антитела, индуцирани както от ваксинация, така и от инфекция. Освен това титрите на неутрализиращите антитела срещу подварианта BA.4 или BA.5 и (в по-малка степен) срещу подварианта BA.2.12.1 са по-ниски от титрите срещу подвариантите BA.1 и BA.2, което предполага, че SARS -Вариантът на омикрон CoV-2 продължава да се развива с увеличаване на неутрализирането на бягството. Тези открития предоставят имунологичен контекст за текущите скокове, причинени от подварианти BA.2.12.1, BA.4 и BA.5 в популации с висока честота на ваксинация и инфекция с BA.1 или BA.2.

Никол П. Хахман, BS
Джесика Милър, BS
Ai-ris Y. Collier, MD
Джон Д. Вентура, д-р.
Jingyou Yu, Ph.D.
Марджъри Роу, бакалавърска степен
Естер А. Бондзи, MSN
Оливия Пауърс, BS
Nehalee Surve, MS
Кевин Хол, BS
Dan H. Barouch, MD, Ph.D.
Медицински център Beth Israel Deaconess, Бостън, Масачузетс
[email protected]

Подкрепено от безвъзмездна помощ (CA260476) от Национални здравни институти (NIH), от Масачузетски консорциум за готовност за патогении от Институт Рагон. д-р Барух е подкрепен от Фондация Мъск. д-р Collier се поддържа от Програмата за развитие на репродуктивните учени на Национален институт за детско здраве и човешко развитие Юнис Кенеди Шрайвърчрез безвъзмездна помощ (HD000849) от Burroughs Wellcome Fund и чрез безвъзмездна помощ (AI69309) от NIH.

Формулярите за разкриване, предоставени от авторите, са достъпни с пълния текст на това писмо на NEJM.org.

Това писмо беше публикувано на 22 юни 2022 г. в NEJM.org.

  1. 1 Виана Р, Мойо С, Amoako DG, et al. Бърза епидемична експанзия на омикронния вариант на SARS-CoV-2 в Южна Африка. природата 2022 г; 603679686.

  2. 2. Целе С, Джаксън Л, Khoury DS, et al. Omicron в голяма степен, но ненапълно избягва неутрализацията на Pfizer BNT162b2. природата 2022 г; 602654656.

  3. 3. Лиу Л, Икетани С, Гуо Й, et al. Поразително избягване на антитела, проявявано от омикронния вариант на SARS-CoV-2. природата 2022 г; 602676681.

  4. 4. Ю Дж., Collier AY, Роу М, et al. Неутрализация на SARS-CoV-2 омикрон BA.1 и BA.2 варианти. N Engl J Med 2022 г; 3861579 г1580 г.

  5. 5. Икетани С, Лиу Л, Гуо Й, et al. Свойства за избягване на антитела на омикронни подлинии SARS-CoV-2. природата 2022 г; 604553556.